Новосибирский институт инженеров геодезии, аэрофотосъемки и картографии был основан в феврале 1933 года как Омский геодезический институт. Со временем этот институт был перебазирован в г. Новосибирск и в 1939 году переименован в Новосибирский институт инженеров геодезии, аэрофотосъемки и картографии (НИИГАиК). После МИИГАиК в Москве это был второй геодезический ВУЗ нашей страны.
В первый год было зачислено 50 студентов. Обучение проводилось также и во время войны. В 1948 г. была создана специальность инженерная геодезия. В 1960 г. НИГАиК принял 400 студентов и выпустил на практику 100 выпускников. Позднее был организован факультет заочного обучения.
В 1968 году было передано в НИИГАиК оборудование планетария. Прибор «Малый Цейс» был смонтирован механиками Московского планетария в «Звёздном зале» и стал обслуживаться сотрудниками кафедры астрономии и гравиметрии НИИГАиК под руководством В. А. Меркушева. Лекции проводились не только для студентов НИИГАиК, но и для жителей города.
С 1977 года стала проводиться профессиональная подготовка иностранных студентов. В 1982 году состоялся первый выпуск граждан Монголии и Кубы, учащихся на прикладной геодезии, картографии и астрономогеодезии.
С 1982 года и по настоящее время в СГУГиТ (НИИГАиК) получили дипломы инженеров, бакалавров, магистров около трёхсот граждан дальнего зарубежья из Кубы, Монголии, Венгрии, Германии, Сирии, Китая, Вьетнама, Лаоса.
Со своим квалифицированным преподавательским составом НИИГАиК имел большую долю в образование молодых кадров геодезии и картографии в нашей стране.
В 1991 году был открыт Технический лицей при академии, в котором учатся школьники 9, 10 и 11 классов.
В 1994 году НИИГАиК переименован в Сибирскую государственную геодезическую академию (СГГА).
С 2005 года Сибирская государственная геодезическая академия и ITE Сибирская ярмарка стали партнерами по организации и проведению международной специализированной выставки и научного конгресса «ГЕО-Сибирь».
28 ноября 2009 г. в СГГА состоялся первый Бал ректора, который решено было сделать ежегодным.
С 2010 года Новосибирский техникум геодезии и картографии (ФГОУСПО НТГиК) стал структурным подразделением Сибирской государственной геодезической академии.
От 8 декабря 2014 года вышел приказ Минобрнауки РФ о переименовании ФГБОУ ВПО «СГГА» в Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Сибирский государственный университет геосистем и технологий», СГУГиТ.